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脱扣器

T细胞受体/免疫球蛋白谱仪(TRIP)


生物导体版本:释放(3.19)

TRIP是一个软件框架,提供抗原受体(B细胞受体免疫球蛋白、BcR-IG|T细胞受体、TR)基因序列数据的分析服务。这是一个用R Shiny编写的web应用程序。它将IMGT/HighV-Quest工具的输出文件作为输入。用户可以选择分别分析每个输入样本的数据,或分析所有样本的组合数据文件,并相应地可视化结果。

作者:Maria Th.Kotouza[aut],Katerina Gemenetzi[aut],Chrysi Galigalidou[aut',Elisavet Vlachonikola[aut].Nikolaos Pechlivanis[cre],Andreas Agathangelidis[aut],Raphael Sandaltzopoulos[aut4],Pericles A.Mitkas[auc],Kostas Stamatopoulos[aut:,阿斯帕西亚·奥法努[aut]

维护人员:Nikolaos Pechlivanis<inab.lists.certh.gr>生物信息学

引文(从R中输入引文(“tripr”))以下为:

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“tripr”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“tripr”)
tripr用户指南 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 BatchEffect(批次效果),基因表达,免疫肿瘤学,多重比较,软件,目标重排序
版本 1.10.0
在生物导体中 生物柴油3.14(R-4.1)(2.5年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 闪亮的(>= 1.6.0),闪亮BS
进口 闪耀(shinyjs),shiny文件,普利尔,数据表,数据传输时间,字符串,字符串主义者,打印3D,额外网格,R彩色啤酒,巧妙地,数字播放器,配置(>= 0.3.1),傀儡(>=0.3.1),方法,grDevices,图形,stats,utils
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/BiodataAnalysisGroup/tripr
错误报告 https://github.com/BiodataAnalysisGroup/tripr/issues
查看更多
建议 生物遗传学,小贩,潮韵诗,生物技术经理,生物串,可发送的,rlist公司,motif堆栈,针织者,rmarkdown公司,测试那个(>= 3.0.0),英尺,仿生风格,参考管理R,生物微粒,撬棍
链接到
增强功能 平行
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 跳闸器_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 跳闸器_1.10.0.zip
macOS二进制(x86_64) 脱扣器_1.10.0.tgz
macOS二进制(arm64) 脱扣器_1.10.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tripr网址
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/tripr
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/tripr网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/tripr网站/
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