脱扣器
T细胞受体/免疫球蛋白谱仪(TRIP)
生物导体版本:释放(3.19)
TRIP是一个软件框架,提供抗原受体(B细胞受体免疫球蛋白、BcR-IG|T细胞受体、TR)基因序列数据的分析服务。这是一个用R Shiny编写的web应用程序。它将IMGT/HighV-Quest工具的输出文件作为输入。用户可以选择分别分析每个输入样本的数据,或分析所有样本的组合数据文件,并相应地可视化结果。
作者:Maria Th.Kotouza[aut],Katerina Gemenetzi[aut],Chrysi Galigalidou[aut',Elisavet Vlachonikola[aut].Nikolaos Pechlivanis[cre],Andreas Agathangelidis[aut],Raphael Sandaltzopoulos[aut4],Pericles A.Mitkas[auc],Kostas Stamatopoulos[aut:,阿斯帕西亚·奥法努[aut]
维护人员:Nikolaos Pechlivanis<inab.lists.certh.gr>生物信息学
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“tripr”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“tripr”)
细节
生物视图 |
BatchEffect(批次效果),基因表达,免疫肿瘤学,多重比较,软件,目标重排序 |
版本 |
1.10.0 |
在生物导体中 |
生物柴油3.14(R-4.1)(2.5年) |
许可证 |
MIT+文件许可证 |
取决于 |
闪亮的(>= 1.6.0),闪亮BS |
进口 |
闪耀(shinyjs),shiny文件,普利尔,数据表,数据传输时间,字符串,字符串主义者,打印3D,额外网格,R彩色啤酒,巧妙地,数字播放器,配置(>= 0.3.1),傀儡(>=0.3.1),方法,grDevices,图形,stats,utils |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/BiodataAnalysisGroup/tripr |
错误报告 |
https://github.com/BiodataAnalysisGroup/tripr/issues |
查看更多
建议 |
生物遗传学,小贩,潮韵诗,生物技术经理,生物串,可发送的,rlist公司,motif堆栈,针织者,rmarkdown公司,测试那个(>= 3.0.0),英尺,仿生风格,参考管理R,生物微粒,撬棍 |
链接到 |
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增强功能 |
平行 |
取决于我 |
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导入我 |
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建议我 |
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指向我的链接 |
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生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。