三联体

DNA分子内三链形成序列的搜索和可视化

生物导体版本：释放（3.19）

该软件包提供了DNA序列中潜在分子内三重模式的识别和可视化功能。其主要功能是检测能够在更大的序列中折叠成分子内三联体（H-DNA）的子序列的位置。潜在的H-DNA（三联体）应该由尽可能多的cannonical核苷酸三联体组成。该软件包包括以1D、2D或3D显示准确基本布线的可视化功能。

作者：Jiri Hon、Matej Lexa、Tomas Martinek和Kamil Rajdl以及Daniel Kopecek的贡献

维护人员：Jiri Hon<gmail.comjiri.Hon>

引文（从R中输入引文（“三元组”）)以下为：

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“triplex”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“triplex”）

生物视图	基因调控,序列匹配,软件
版本	1.44.0
在生物导体中	生物C 2.12（R-3.0）（11年）
许可证	BSD_2_clause+文件许可证
取决于	R（>=2.15.0），S4载体(>= 0.5.14),I范围(>= 2.5.27),十六矢量(>= 0.11.6),生物串(>= 2.39.10)
进口	方法，网格，基因组学范围
系统要求
统一资源定位地址	网址：http://www.fi.muni.cz/~lexa/triplex公司/

建议	rgl公司(>= 0.93.932),英国基因组。西里根。UCSC.ce10,rtracklayer公司
链接到	S4载体,I范围,十六矢量,生物串
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	三重_1.44.0.tar.gz
Windows二进制	三芯_1.44.0.zip
macOS二进制（x86_64）	三重_1.44.0.tgz
macOS二进制（arm64）	三重_1.44.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/triplex网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：套餐/三联套餐
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/triplex网站/
包短Url	https://bioductor.org/packages/triplex/
软件包下载报告	下载统计信息