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变换GamPoi

Gamma-Poisson模型的方差稳定变换


生物导体版本:释放(3.19)

方差稳定转换有助于分析异方差数据(即方差不恒定的数据,如计数数据)。该软件包提供了两种类型的方差稳定化变换:(1)基于delta方法的方法(例如,“acosh”、“log(x+1)”),(2)基于模型残差的方法(Pearson和随机分位数残差)。

作者:康斯坦丁·阿赫曼·埃尔泽

维护人员:Constantin Ahlmann-Eltze<artjom31415,网址:googlemail.com>

引文(从R中输入引文(“transformGamPoi”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“transformGamPoi”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“transformGamPoi”)
glmGamPoi快速启动 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 规范化,预处理,回归,单个单元格,软件
版本 1.10.0
在生物导体中 生物柴油3.14(R-4.1)(2.5年)
许可证 GPL-3型
取决于
进口 全球伽马波依,延迟阵列,矩阵,矩阵泛型,总结性实验,HDF5阵列、方法、实用程序,卢比
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/const-ae/transformGamPoi
错误报告 https://github.com/const-ae/transformGamPoi/issues网站
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 变换GamPoi_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 转换GamPoi_1.10.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 变换GamPoi_1.10.0.tgz
macOS二进制(arm64) 变换GamPoi_1.10.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/transformGamPoi
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/转换器GamPoi
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/transformGamPoi/
包短Url https://bioconductor.org/packages/transformGamPoi/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.19的旧源代码包 源存档