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托马斯克

用于分析Tomo-seq数据的R包


生物导体版本:释放(3.19)

`tomoseqr`是一个用于分析Tomo-seq数据的R包。Tomo-seq是一种全基因组RNA层析成像方法,它将高通量RNA测序与冷冻切片相结合,用于空间分辨转录组学`tomoseqr`从tomoseq数据重建3D表达模式,并可视化重建的3D表达模式。

作者:松泽良介[aut,cre]

维护人员:松泽良介<kinakomochi.work at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“tomoseqr”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“tomoseqr”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“tomoseqr”)
托马斯克 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 基因表达式,RNA序列,排序,软件,空间,转录组学,可视化
版本 1.8.0
在生物导体中 生物柴油3.15(R-4.2)(2年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 R(>=4.2)
进口 gr设备、图形、,动画,易怒的,数字播放器,字符串,呜呜声、方法、,闪亮的,生物文件缓存,阅读器、工具、,巧妙地,ggplot2
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 托马斯克-1.8.0.tar.gz
Windows二进制 托马斯克-1.8.0.zip
macOS二进制(x86_64) 托马斯克-1.8.0.tgz
macOS二进制(arm64) 托马斯克-1.8.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/tomoseqr网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/tomoseqr
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/tomoseqr网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/tomoseqr网站/
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