注册打开对于生物20247月24-26日

合成纤维

合成致命RNAi筛选数据的命中率选择


生物导体版本:释放(3.19)

从合成致命RNAi屏幕数据中选择点击。例如,有两个相同的细胞系,但一个基因在一个细胞系中被敲除。人们的兴趣是找到那些被siRNA进一步敲除后导致更强致死效应的基因。质量控制和各种可视化工具得到了实现。可以使用四种不同的算法来拾取有趣的点击。该软件包是基于384个井板设计的,但可能适用于具有适当配置的其他平台。

作者:邵春暄[aut,cre]

维护人员:邵春萱<outlook.com>

引文(从R中输入引文(“synlet”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“synlet”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“synlet”)
synlet的工作演示 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 基于细胞的分析,特征提取,免疫肿瘤学,预处理,质量控制,软件,可视化
版本 2.4.0
在生物导体中 生物技术3.2(R-3.2)(8.5年)
许可证 GPL-3型
取决于 R(>=3.5.0)
进口 数据表,ggplot2,gr设备,马格里特、方法、,拼凑,RankProd公司,R彩色啤酒,统计,实用程序
系统要求
统一资源定位地址
查看更多
建议 生物风格,针织物,测试那个,rmarkdown公司
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 合成塔2.4.0.tar.gz
Windows二进制 合成橡胶_2.4.0.zip
macOS二进制(x86_64) 合成塔2.4.0.tgz
macOS二进制(arm64) 合成塔2.4.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/synlet
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/synlet
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/synlet/
包短Url https://bioductor.org/packages/synlet/
软件包下载报告 下载统计信息