辣味R
原位细胞术数据的空间分析
生物导体版本：释放（3.19）
spicyR包提供了一个框架，用于对细胞分辨率空间组学技术中成对细胞类型之间的空间关系的变化进行推断。spicyR包括三个主要步骤：（i）总结每幅图像的细胞类型对之间的空间定位程度；（ii）将定位汇总统计中的可变性建模为细胞计数的函数，以及（iii）测试与响应变量相关的空间定位变化。
作者：尼古拉斯·卡内特【aut】、埃利斯·帕特里克【aut，cre】、尼古拉斯·罗伯逊【ctb】、亚历克斯·秦【ctb）
维护人员：埃利斯·帕特里克（Ellis Patrick at sydney.edu.au）
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“spicyR”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览Vignette（“spicyR”）
细节
| 生物视图 |
基于细胞的分析,单个单元格,软件,空间 |
| 版本 |
1.16.4 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.11（R-4.0）（4.5年） |
| 许可证 |
GPL（>=2） |
| 取决于 |
R（>=4.1） |
| 进口 |
ggplot2,凹地人,生物并行,spastat.explore软件,spastat.geom公司,lmer测试,S4载体、方法、，情势图,爱尔兰航空公司，gr设备，统计，数据表,数字播放器,第三年,骗局,单细胞实验,空间实验,总结性实验,gg力,分类器,易怒的,马格里特,克莱,字体外 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://ellispatrick.github.io/spicyR/https://github.com/SydneyBioX/spicyR https://sydneybiox.github.io/spicyR网址/ |
| 错误报告 |
https://github.com/SydneyBioX/spicyR/问题 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
