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类似R峰值

估计两个ChIP-Seq配置文件之间相似程度的指标


生物导体版本:释放(3.19)

该软件包计算量化ChIP-Seq配置文件之间相似性水平的度量。更具体地说,该包实现了六个伪度量,专门用于ChIP-Seq配置文件中的模式相似性检测。

作者:Astrid Deschánes[cre,aut],Elsa Bernatchz[aut]

维护人员:Astrid Deschánes<adeschen at hotmail.com>

引文(从R中输入引文(“similaRpeak”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“similaRpeak”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“similaRpeak”)
两个ChIP-Seq配置文件之间的相似性 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 生物学问题,ChIPSeq公司,差异表达式,遗传学,多重比较,软件
版本 1.36.0
在生物导体中 生物技术3.1(R-3.2)(9年)
许可证 艺术-2.0
取决于 R6级(>= 2.0)
进口 统计数据
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/adeschen/similaRpeak网站
错误报告 https://github.com/adeschen/similaRpeak/issues(https://github.com/adeschen/similaRpeak/issues)
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 类似Rpeak_1.36.0.tar.gz
Windows二进制 类似Rpeak_1.36.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 类似Rpeak_1.36.0.tgz
macOS二进制(arm64) 类似Rpeak_1.36.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/similaRpeak网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/类似Rpeak
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/similaR峰值/
包短Url https://bioconductor.org/packages/similaRpeak网站/
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