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seqPattern（序列模式）

可视化一组排序序列中的寡核苷酸模式和基序出现


生物导体版本：释放（3.19）

可视化寡核苷酸模式和序列模体在一组以公共参考点为中心的序列中的出现，并按用户定义的特征进行排序。

作者：Vanja Haberle<Vanja.Haberle at gmail.com>

维护人员：Vanja Haberle<Vanja.Haberle at gmail.com>

引文（从R中输入引文（“seqPattern”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“seqPattern”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“seqPattern”）
seqPattern（序列模式） PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
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细节

生物视图 序列匹配,软件,可视化
版本 1.36.0
在生物导体中 生物多样性3.1（R-3.2）（9.5年）
许可证 GPL-3公司
取决于 方法，R（>=2.15.0）
进口 生物串,基因组范围,I范围,科恩平滑,倍体
系统要求
统一资源定位地址
查看更多
建议 英国基因组。德雷奥.UCSC.danRer7,CAGEr公司,RUnit（运行单位）,生物遗传学,仿生风格
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增强功能 平行
取决于我
导入我 基因形成,seqArchRplus系列
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 序列模式n_1.36.0.tar.gz
Windows二进制 序列图案_1.36.0.zip（仅64位）
macOS二进制（x86_64） 序列图案_1.36.0.tgz
macOS二进制（arm64） 序列图案_1.36.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/seqPattern
源存储库（开发人员访问） git克隆git@git.bioconductor.org：packages/seqPattern
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/seqPattern网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/seqPattern/
软件包下载报告 下载统计信息