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sechm:来自总结实验的复杂热图


生物导体版本:释放(3.19)

sechm在SummarizedExperiment对象和ComplexHeatmap包之间提供了一个简单的接口。它支持从SE对象绘制带注释的热图,可以轻松访问rowData和colData列,并实现了许多功能,使热图的生成更容易、更灵活。这些功能过去是SEtools包的一部分。

作者:皮埃尔·卢克·日尔曼[cre,aut]

维护人员:皮埃尔·卢克·日尔曼

引文(从R中输入引文(“sechm”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“秒”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“sechm”)
HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 基因表达式,软件,可视化
版本 1.12.0
在生物导体中 生物化学3.13(R-4.1)(3年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=4.0),总结性实验,复杂热图
进口 S4载体,系列化,绕圈子、方法、,随机coloR,统计,网格,grDevices,矩阵统计
系统要求
统一资源定位地址
错误报告 网址:https://github.com/plger/sechm
查看更多
建议 生物风格,针织物,rmarkdown公司
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取决于我 SE工具
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 秒_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 秒_1.12.0.zip
macOS二进制(x86_64) 秒_1.12.0.tgz
macOS二进制(arm64) 秒_1.12.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/sechm网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/秒
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/sechm网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/sechm/
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