屏幕计数器

高通量排序屏幕中的读取计数

生物导体版本：释放（3.19）

提供从高通量测序屏幕数据（如CRISPR、shRNA）中计数读取数的功能，以量化条形码丰度。目前支持单个或成对输入数据中的单个条形码，以及成对输出数据中的组合条形码。

作者：亚伦·伦〔aut，cre〕

维护人员：亚伦·伦（Aaron Lun）<infine.monkeys.with.keyboards at gmail.com>

引文（从R中输入引文（“screenCounter”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“屏幕计数器”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“屏幕计数器”）

生物视图	对齐,CRISPR公司,功能基因组学,功能预测,软件
版本	1.4.0
在生物导体中	生物柴油3.17（R-4.3）（1.5年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	S4载体,总结性实验
进口	卢比,zlibbico公司,生物并行
系统要求	C++17，GNU制造
统一资源定位地址	https://github.com/crisprVerse/screenCounter网站
Bug报告	https://github.com/crisprVerse/screenCounter/issues

建议	生物遗传学,生物串,生物风格,针织物,rmarkdown公司,测试那个
链接到	卢比
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	屏幕计数器_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	屏幕计数器_1.4.0.zip（仅64位）
macOS二进制（x86_64）	屏幕计数器_1.4.0.tgz
macOS二进制（arm64）	屏幕计数器_1.4.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/screenCounter网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/屏幕计数器
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/screenCounter网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/screenCounter网站/
软件包下载报告	下载统计信息