注册打开对于生物20247月24-26日

scoreInvHap评分

获取预定义区域中的反转状态


生物导体版本:释放(3.19)

scoreInvHap可以得到样本对已知反转的反转状态。scoreInvHap使用SNP数据作为输入,需要以下关于反转的信息:不同单倍型中的基因型频率、区域SNP之间的R2和反转状态以及参考中的杂合子基因型。该软件包包含21个反演的数据。

作者:卡洛斯·鲁伊斯[aut]、多洛斯·佩莱格里[aut]、胡安·冈萨雷斯[aut,cre]

维护人员:Dolors Pelegri-So<Dolors.Pelegri at isglobal.org>

引文(从R中输入引文(“scoreInvHap”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“scoreInvHap”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“scoreInvHap”)
利用scoreInvHap进行反转基因分型 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
许可证 文本

细节

生物视图 遗传学,基因组变异,SNP公司,软件
版本 1.26.0
在生物导体中 生物技术3.6(R-3.4)(6.5年)
许可证 文件许可证
取决于 R(>=3.6.0)
进口 生物串、方法、,snp状态,变量注释,基因组范围,BiocParallel公司、图形、,总结性实验
系统要求
统一资源定位地址
查看更多
建议 测试那个,针织者,仿生风格,rmarkdown公司
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 scoreInvHap_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 scoreInvHap_1.26.0.zip
macOS二进制(x86_64) scoreInvHap_1.26.0.tgz
macOS二进制(arm64) scoreInvHap_1.26.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scoreInvHap
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/scoreInvHap
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/scoreInvHap/
包短Url https://bioconductor.org/packages/scoreInvHap/
软件包下载报告 下载统计信息