scmap（scmap）
单细胞RNA-seq数据的无监督投影工具
生物导体版本：释放（3.19）
单细胞RNA-seq（scRNA-seg）被广泛用于研究复杂组织的组成，因为该技术允许研究人员使用转录组的无监督聚类来定义细胞类型。然而，由于实验方法和计算分析的差异，直接比较两个不同实验中确定的细胞通常具有挑战性。scmap是一种将scRNA-seq实验中的细胞投影到不同实验中确定的细胞类型或单个细胞上的方法。
作者：弗拉基米尔·基塞列夫
维护人员：弗拉基米尔·基斯列夫（Vladimir Kiselev）<Vladimir.yu.Kiselev at gmail.com>
安装
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如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“scmap”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
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细节
| 生物视图 |
分类,数据导入,数据表示,基因表达式,免疫肿瘤学,预处理,RNA序列,排序,单个单元格,软件,支持向量机,转录,转录组学,可视化 |
| 版本 |
1.26.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.6（R-3.4）（6.5年） |
| 许可证 |
GPL-3型 |
| 取决于 |
R（>=3.4） |
| 进口 |
博科生物,单细胞实验,总结性实验,生物遗传学,S4载体,数字播放器,重塑2,矩阵统计,代理，实用程序，谷歌视觉,ggplot2，方法，统计信息，e1071号,随机森林,卢比(>= 0.12.12) |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/hemberg-lab/scmap |
| 错误报告 |
https://support.bioconductor.org/t/scmap/ |
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程序包档案
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