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scTHI公司

从单细胞RNA测序数据鉴定细胞簇间显著活化的配体-受体相互作用


生物导体版本:释放(3.19)

scTHI是一个R包,用于识别单个细胞中的活性配体受体对,以便研究肿瘤与宿主的相互作用。scTHI包含一组特征,用于将细胞与肿瘤微环境进行分类。

作者:弗朗西丝卡·皮亚·卡鲁索[aut],米歇尔·塞卡雷利[aut,cre]

维护人员:米歇尔·塞卡雷利

引文(从R中输入引文(“scTHI”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“scTHI”)

对于旧版本的R,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“scTHI”)
使用scTHI HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 单个单元格,软件
版本 1.16.0
在生物导体中 生物柴油3.11(R-4.0)(4年)
许可证 GPL-2型
取决于 R(>=4.0)
进口 生物并行,Rtsne公司,gr设备,图形,统计
系统要求
统一资源定位地址
错误报告 https://github.com/miccec/scTHI/issues网站
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 scTHI_1.16.0.tar.gz标准
Windows二进制 scTHI_1.16.0.zip文件(仅64位)
macOS二进制(x86_64) scTHI_1.16.0.tgz型
macOS二进制(arm64) scTHI_1.16.0.tgz型
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scTHI网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/scTHI
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/scTHI网址/
包短Url https://bioconductor.org/packages/scTHI网站/
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