scPCA公司
稀疏对比主成分分析
生物导体版本:释放(3.19)
高维生物数据稀疏对比主成分分析(scPCA)工具箱。scPCA结合了稀疏PCA的稳定性和可解释性,以及对比PCA通过使用控制数据将生物信号从不需要的变化中分离出来的能力。还实现并扩展了cPCA。
作者:菲利普·博伊奥[aut,cre,cph]
,尼玛·赫贾齐[aut]
,Sandrine Dudoit[ctb,ths]
维护人员:菲利普·波洛<Philippe_Boileau at berkeley.edu>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“scPCA”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览渐晕图(“scPCA”)
细节
生物视图 |
差异表达式,基因表达式,微阵列,主要组件,RNA序列,排序,软件 |
版本 |
1.18.0 |
在生物导体中 |
生物技术3.10(R-3.6)(4.5年) |
许可证 |
MIT+文件许可证 |
取决于 |
R(>=4.0.0) |
进口 |
统计、方法、,断言,易怒的,数字播放器,呜呜声,字符串,Rdpack公司,矩阵统计,生物并行,弹性网,斯帕塞普卡,集群,内核实验室,折纸,R光谱,笼子,矩阵,延迟阵列,缩放矩阵,矩阵泛型 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/PhilBoileau/scPCA |
错误报告 |
https://github.com/PhilBoileau/scPCA/issues网站 |
查看更多
建议 |
延迟矩阵统计,稀疏矩阵统计,测试那个(>= 2.1.0),覆盖(covr),针织物,rmarkdown公司,生物风格,ggplot2,ggpubr公司,飞溅,单细胞实验,微基准 |
链接到 |
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增强功能 |
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取决于我 |
OSCA高级、OSCA工作流 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。