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scFeatureFilter(scFeature过滤器)

一种基于相关性的单细胞RNAseq数据质量滤波方法


生物导体版本:释放(3.19)

Joshi实验室开发的基于相关性的方法的R实现,用于分析和过滤处理过的单细胞RNAseq数据。它返回一个过滤版本的数据,只包含不受系统噪声影响的基因表达值。

作者:Angeles Arzalluz-Luque[aut]、Guillaume Devailly[aut,cre]、Anagha Joshi[aut]

维护人员:纪尧姆·德瓦利<gdevailly at hotmail.com>

引文(从R中输入引文(“scFeatureFilter”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“scFeatureFilter”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“scFeatureFilter”)
scFeatureFilter简介 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 基因表达式,免疫肿瘤学,预处理,RNA序列,单个单元格,软件
版本 1.24.0
在生物导体中 生物技术3.7(R-3.5)(6年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 R(>=3.6)
进口 数字播放器(>= 0.7.3),ggplot2(>= 2.1.0),马格里特(>= 1.5),爱尔兰航空公司(>= 0.1.2),易怒的(>=1.3.4),统计,方法
系统要求
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 scFeatureFilter_1.24.0.tar.gz功能过滤器
Windows二进制 scFeatureFilter_1.24.0.zip
macOS二进制(x86_64) scFeatureFilter_1.24.0.tgz
macOS二进制(arm64) scFeatureFilter_1.24.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/scFeatureFilter网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/scFeatureFilter
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/scFeatureFilter网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/scFeatureFilter网站/
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