桑杰纳利瑟
sangeranalyseR：一套用于分析R中Sanger序列数据的函数
生物导体版本：释放（3.19）
这个包构建在sangerseqR之上，允许用户从Sanger测序读取的集合中创建contigs。它为许多常见的操作提供了广泛的选项，包括读取微调、检测二次峰值和使用参考序列检测索引。所有参数都可以在R或相关的Shiny应用程序中进行交互调整。有大量的在线文档，该包可以输出详细的HTML报告，包括色谱图。
作者：罗布·兰费尔（Rob Lanfear）、关浩超（Kuan Hao Chao）、霍华德（Rob Lanfear）和gmail.com>
维护人员：赵匡浩（音译）<ntueeb05howard at gmail.com>
引文（从R中输入引文（“sangeranalyseR”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“sangeranalyseR”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“sangeranalyseR”）
细节
| 生物视图 |
对齐,图形用户界面,遗传学,预处理,质量控制,SangerSeq公司,排序,软件,可视化 |
| 版本 |
1.14.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.12（R-4.0）（4年） |
| 许可证 |
GPL-2基因 |
| 取决于 |
R（>=4.0.0），字符串,猿,生物串,pwalling（pwallign）,破译，平行，重新整形2,sangerseqR公司,额外网格,闪亮的,闪亮的仪表板,闪耀（shinyjs）,数据表,巧妙地,DT公司,狂热分子,卓越R,小型装载机,ggdendro公司,闪亮小工具,开放式xlsx、工具、，rmarkdown公司(>= 2.9),针织物(>= 1.33),顺序,生物风格,记录器 |
| 进口 |
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| 系统要求 |
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| 统一资源定位地址 |
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查看更多
| 建议 |
测试那个(>= 2.1.0) |
| 链接到 |
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| 增强功能 |
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| 取决于我 |
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| 建议我 |
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| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
