rifi比较

“rifiComparative”比较两种不同条件下的rifi输出。


生物导体版本:释放(3.19)

“rifiComparative”是rifi包的延续。它使用半衰期和mRNA在时间0段比较了两种条件下的rifi输出。作为分割的输入,使用两种条件的半衰期和mRNA在时间0的log2FC之间的差异。该软件包提供了分段、统计、汇总表、片段可视化和一些其他有用的绘图,以供进一步分析。

作者:Loubna Youssar[aut,cre],Jens cre Georg[aut]

维护人员:Loubna Youssar<lyoussar at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“rifiComparative”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“rifiComparative”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“rifiComparative”)
rifi比较 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 差异表达式,基因调控,微阵列,RNA序列,软件,转录组学
版本 1.4.0
在生物导体中 生物柴油3.17(R-4.3)(1.5年)
许可证 GPL-3+文件许可证
取决于 R(>=4.2)
进口 奶牛场,doMC(美国国防部长办公室),平行,数字播放器,鸡蛋,foreach公司,ggplot2,gg排斥,图形,grDevices,网格,方法,奈特,爱尔兰航空公司,S4载体,规模,统计,字符串,易怒的,无线电跟踪器,实用程序,Writex(写入),数据传输协议,LSD公司,重塑2,开发工具,总结性实验
系统要求
统一资源定位地址
错误报告 https://github.com/CyanolabFreiburg/rifi比较
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 rifi比较_1.4.0.tar.gz
Windows二进制
macOS二进制(x86_64) rifi比较_1.4.0.tgz
macOS二进制(arm64) rifi比较_1.4.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rifiComparative网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/rifiComparative
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/rifi比较/
包短Url https://bioconductor.org/packages/rifiComparative网站/
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