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rBLAST公司

基本局部对齐搜索工具的R接口


生物导体版本:释放(3.19)

无缝连接基本局部比对搜索工具(BLAST)以搜索遗传序列数据库。这项工作得到了国家人类基因组研究所(National Human Genome Research Institute)R21HG005912号赠款的部分支持。

作者:迈克尔·哈斯勒,Nagar Anurag[作者]

维护人员:迈克尔·哈斯勒(Michael Hahsler)<mhahsler at lyle.smu.edu>

引文(从R中输入引文(“rBLAST”))以下为:

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“rBLAST”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“rBLAST”)
rBLAST:R基本局部对齐搜索工具的接口 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
安装 文本

细节

生物视图 对齐,数据导入,遗传学,序列匹配,排序,软件
版本 1.0.0
在生物导体中 生物活性碳3.19(R-4.4)(<6个月)
许可证 GPL-3公司
取决于 生物串(>= 2.26.2)
进口 方法、实用程序、,生物文件缓存
系统要求 ncbi-碎屑+
统一资源定位地址 https://github.com/mhahsler/rBLAST
错误报告 https://github.com/mhahsler/rBLAST/问题
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 rBLAST_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 rBLAST_1.0.0.zip文件
macOS二进制(x86_64) rBLAST_1.0.0.tgz
macOS二进制(arm64) rBLAST_1.0.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/rBLAST
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/rBLAST
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/rBLAST/
包短Url https://bioconductor.org/packages/rBLAST/
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