菲尔

基于系统发育分区的宏基因组数据ILR变换

生物导体版本：释放（3.19）

PhILR是系统发育等距Log-Ratio变换的缩写。该软件包提供了成分数据分析功能（例如，代表不同变量/零件比例的数据）。特别是，该软件包允许分析成分数据，其中可以通过系统发育树（在微生物群调查数据中常见）关联各个部分，并提供从系统发育树构建的等距对数比变换，并使用加权参考度量。

作者：贾斯汀·西尔弗曼[aut，cre]，利奥·拉赫蒂[ctb]

维护人员：贾斯汀·西尔弗曼（Justin Silverman）<jsilve24 at gmail.com>

引文（从R中输入引文（“philr”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“philr”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“philr”）

生物视图	免疫肿瘤学,基因组,微生物组,排序,软件
版本	1.30.0
在生物导体中	生物柴油3.4（R-3.3）（7.5年）
许可证	GPL-3型
取决于
进口	猿,潘戈恩,第三年,ggplot2,ggtree公司，方法
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/jsilve24/philr
错误报告	https://github.com/jsilve24/hilr/issues（网址：https://github.com/jsilve24/hilr/issues）

建议	测试那个,针织物,生态学者,rmarkdown公司,生物风格,品学兼优,总结性实验,树总结实验,格尔姆奈特,数字播放器,米娅
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	菲尔-1.30.0.tar.gz
Windows二进制	菲尔-1.30.0.zip
macOS二进制（x86_64）	菲尔-1.30.0.tgz
macOS二进制（arm64）	菲尔-1.30.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/philr
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：程序包/philr
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/philr/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/philr/
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