成对GSEA
用于基因集富集分析的配对DGE和DGS分析
生物导体版本：释放（3.19）
配对GSEA使配对差异基因表达（DGE）和差异基因拼接（DGS）分析变得简单。如果需要，该软件包允许您存储中间结果以供进一步调查。pairedGSEA附带了一个用于运行过表达分析（ORA）的包装器函数和用于绘制结果的功能。
作者：瑟伦·海尔威格大坝[cre，aut]
，Lars Rønn Olsen[奥特]，克里斯托弗·维廷·塞鲁普[aut]
维护人员：瑟伦·海尔威格大坝<dtu.dk处的sohdam>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“pairedGSEA”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“成对GSEA”）
细节
| 生物视图 |
替代复制,差异表达式,差分拼接,基因表达式,GeneSet扩展,免疫肿瘤学,路径,RNA序列,软件,转录 |
| 版本 |
1.4.0 |
| 在生物导体中 |
生物C 3.17（R-4.3）（1年） |
| 许可证 |
MIT+文件许可证 |
| 取决于 |
R（>=4.3.0） |
| 进口 |
DESeq2公司,DEXSeq公司,利马,fgsea公司,特别行政区,总结性实验,S4载体,生物并行,ggplot2,聚合，stats，utils，方法 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/shdam/pairedGSEA网站 |
| 错误报告 |
https://github.com/shdam/pairedGSEA/issues |
查看更多
| 建议 |
Writex（写入）,读xl,阅读器,rhdf5基因,msigdbr公司,巧妙地,测试那个(>= 3.0.0),针织物,rmarkdown公司,冠状病毒,生物风格 |
| 链接到 |
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| 增强功能 |
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| 取决于我 |
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| 导入我 |
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| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
