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帕德玛

使用多因素分析的个体化多目标路径偏离得分


生物导体版本:释放(3.19)

使用多因素分析计算基于多组分分析(如RNA-seq、拷贝数改变、甲基化等)的抽样人群的个体化路径中心偏差分数。提供图形和数字输出,以识别特定路径的高度异常个体,以及异常多组分谱的基因和组学驱动因素。

作者:安德烈亚·劳(Andrea Rau)[cre,aut]、雷吉娜·马南萨拉[aut]、佛罗伦斯·贾夫雷齐克[ctb]、丹尼斯·拉洛[aut'、保罗·奥尔[aut]

维护人员:安德烈亚·劳(Andrea Rau)

引文(从R中输入引文(“padma”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“padma”)

对于旧版本的R,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“padma”)
padma包:快速入门指南 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 BioCarta公司,基因表达式,甲基Seq,路径,主要组件,RNA序列,软件,统计方法
版本 1.14.0
在生物导体中 生物柴油3.12(R-4.0)(3.5年)
许可证 GPL(>=3)
取决于 R(>=4.1.0),总结性实验,S4载体
进口 事实矿工,多重分析实验,方法,图形,统计,实用程序
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/andreamrau/padma
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 padma_1.14.0.tar.gz
Windows二进制 padma_1.14.0.zip
macOS二进制(x86_64) padma_1.14.0.tgz
macOS二进制(arm64) padma_1.14.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/padma
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/padma
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/padma/
包短Url https://bioconductor.org/packages/padma/
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