openPrimeR（打开底漆）
多重PCR引物设计与分析
生物导体版本：释放（3.19）
设计、评估和比较多重PCR引物集的方法的实现。通过求解集合覆盖问题来设计引物，使覆盖的模板序列的数量用尽可能少的引物集达到最大。为了保证产生高质量的引物，只选择满足物理化学性质约束的引物。“openPrimeRui”软件包提供了一个Shiny应用程序，为该软件包的功能提供了用户界面。
作者：Matthias Döring[aut，cre]，Nico Pfeifer[aut]
维护人员：马蒂亚斯·多林（Matthias Döring）
引文（从R中输入引文（“openPrimerR”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“openPrimeR”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“openPrimeR”）
细节
| 生物视图 |
新闻报道,多重比较,软件,技术 |
| 版本 |
1.26.0 |
| 在生物导体中 |
生物技术3.6（R-3.4）（7年） |
| 许可证 |
GPL-2型 |
| 取决于 |
R（>=4.0.0） |
| 进口 |
生物串(>= 2.38.4),pwalling（pwallign）,XML格式(>= 3.98-1.4),规模(>= 0.4.0),重塑2(>= 1.4.1),顺序(>= 3.3-3),I范围(>= 2.4.8),基因组范围(>= 1.22.4),ggplot2(>= 2.1.0),普利尔(>= 1.8.4),数字播放器(>= 0.5.0),字符串主义者(>= 0.9.4.1),字符串(>= 1.0.0),R彩色啤酒(>= 1.1-2),DECIPHER公司(>= 1.16.1),lpSolveAPI（解决方案API）(>= 5.5.2.0-17),消化(>= 0.6.9),Hmisc公司(>= 3.17-4),猿(>= 3.5),生物遗传学(>= 0.16.1),S4载体(>= 0.8.11),foreach公司(>= 1.4.3),马格里特(>= 1.5),uniqtag公司(>= 1.0),开放式xlsx（>=4.0.17），网格（>=3.1.0），grDevices（>=3.10），stats（>=3.1.0），utils（>=3.1），methods（>=31.0） |
| 系统要求 |
MAFFT（>=7.305）、OligioArrayAux（>=3.8）、ViennaRNA（>=2.4.1）、MELTING（>=5.1.1）、Pandoc（>=1.12.3） |
| 统一资源定位地址 |
|
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
