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网络经济学

基于多麦克风(时程)网络的集成和解释


生物导体版本:释放(3.19)

netOmics是一个多经济体网络构建者和探索者。它使用网络推理算法和基于知识的图的组合来构建多层网络。该软件包可以与timeOmics结合,以合并时间进程表达式数据,并从多组分动力学簇构建子网络。最后,通过生成的多组分网络,传播分析可以识别缺失的生物功能(1)、多组分机制(2)和动力学簇之间的分子(3)。这有助于解决复杂的监管机制。

作者:安托万·博登[aut,cre]

维护人员:安托万·博登(Antoine Bodein<Antoine.Bodein.1 at ulaval.ca>)

引文(从R中输入引文(“netOmics”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“netOmics”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

参考手册 PDF格式

细节

生物视图 图形和网络,网络,网络推理,软件,系统生物学,时间课程,工作流步骤
版本 1.10.0
在生物导体中 生物柴油3.14(R-4.1)(2.5年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=4.1)
进口 数字播放器,ggplot2,记录仪,马格里特,地雷,呜呜声,易怒的,第三年,注释Dbi,政府.db,g配置文件2、方法、,矩阵,统计信息
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/abodein/netOmics网站
错误报告 https://github.com/abodein/netOmics/issues网站
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建议 mixOmics公司,timeOmics公司,潮韵诗,仿生风格,测试那个,冠状病毒,rmarkdown公司,针织物
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程序包档案

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源程序包
Windows二进制
macOS二进制(x86_64)
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/netOmics网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/netOmics
包短Url https://bioconductor.org/packages/netOmics网站/
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