ndexr公司

NDEx R客户端库


生物导体版本:释放(3.19)

此软件包提供了NDEx服务器的接口,例如位于http://ndexbio.org/。它可以通过API检索和保存网络。网络以RCX对象和igraph表示形式提供。

作者:弗洛里安·奥尔[cre,aut]、弗兰克·克莱默、亚历克斯·伊什金、德克斯特·普拉特

维护人员:弗洛里安·奥尔(Florian Auer)<弗洛里安·阿埃尔(Florian.Auer)at informatik.uni-augsburg.de>

引文(从R中输入引文(“ndexr”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“ndexr”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“ndexr”)
NDExR渐晕图 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 数据导入,网络,路径,软件
版本 1.26.0
在生物导体中 生物技术3.6(R-3.4)(7年)
许可证 BSD_3_clause+文件许可证
取决于 RCX公司
进口 高温气冷堆,jsonlite公司,普利尔,第三年
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/frankkramer-lab/ndexr
错误报告 https://github.com/frankkramer-lab/ndexr/问题
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 索引r_1.26.0.tar.gz
Windows二进制 ndexr_1.26.0.zip文件
macOS二进制(x86_64) 索引r_1.26.0.tgz
macOS二进制(arm64) 索引r_1.26.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/ndexr
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/ndexr
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/ndexr网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/ndexr/
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