多阶段QTL

多状态QTL数据分析工具包


生物导体版本:释放(3.19)

用于对多状态QTL数据进行各种分析的工具集合,重点是可视化和解释。“multistateQTL”包包含一些功能,可以删除或插补缺失数据,识别重要关联,以及将特征分类为全局、多状态或唯一。分析结果存储在基于“总结实验”框架的“QTLE实验”对象中。

作者:克里斯蒂娜·德尔·阿佐迪[aut]、戴维斯·麦卡锡[ctb]、阿米莉亚·邓斯通[cre,ctb]

维护人员:阿米莉亚·邓斯通(Amelia Dunstone)

引文(从R中输入引文(“multistateQTL”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“multistateQTL”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“multistateQTL”)
multistateQTL:R中的多状态QTL分析 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 功能基因组学,基因表达式,SNP公司,排序,软件,可视化
版本 1.0.0
在生物导体中 生物C 3.19(R-4.4)(<6个月)
许可证 GPL-3公司
取决于 QTLE实验,总结性实验,复杂热图,数据表,崩溃
进口 方法,S4载体,网格,数字播放器,第三年,矩阵统计,统计,菲迪斯特普卢斯,病毒属,ggplot2,绕圈子,捣碎机,gr设备
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/dunstone-a/multistateQTL
错误报告 https://github.com/dunstone-a/多状态QTL/issues
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 多级QTL_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 多级QTL_1.0.0.zip
macOS二进制(x86_64) 多级QTL_1.0.0.tgz
macOS二进制(arm64)
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/multistateQTL网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/multistateQTL
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/multistateQTL(网址:https://code.bioconductor.org/browse/multistateQTL)/
包短Url https://bioconductor.org/packages/multistateQTL网站/
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