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莫斯戴夫

MOSt常用且有用的微分表达式函数


生物导体版本:释放(3.19)

此包提供了在差异表达式分析工作流中运行多个任务的功能。这包括使用最广泛的步骤,从使用统一界面运行各种浓缩分析工具,到创建绘图和美化链接到外部网站和数据库的表组件。这简化了综合分析报告的生成。

作者:Leon Dammer(导演),费德里科·马里尼[aut,cre]

维护人员:费德里科·马里尼<marinif在uni mainz.de>

引文(从R中输入引文(“mosdef”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“mosdef”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“mosdef”)
mosdef用户指南 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 差异表达式,GO(开始),基因表达式,GeneSet扩展,报告写作,软件,转录,转录组学,可视化
版本 1.0.0
在生物导体中 生物C 3.19(R-4.4)(<6个月)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 R(>=4.4.0)
进口 DT公司,ggplot2,gg力,gg排斥,html工具、方法、,注释Dbi,topGO(顶GO),政府.db,clusterProfiler(群集探查器),戈塞克,实用程序,R彩色啤酒,爱尔兰航空公司,DESeq2公司,规模,总结性实验,S4载体,统计信息
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/imbeimainz/mosdef
错误报告 https://github.com/imbeimainz/mosdef/issues网站
查看更多
建议 针织物,rmarkdown公司,巨噬细胞,组织Hs.eg.db,GeneTonic公司,测试那个(>= 3.0.0),TxDb(发送日期)。哈皮恩斯。UCSC.hg38.known基因,生物风格
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取决于我
导入我
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 mosdef_1.0.0.tar.gz
Windows二进制 mosdef_1.0.0.zip
macOS二进制(x86_64) mosdef_1.0.0.tgz
macOS二进制(arm64) mosdef_1.0.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mosdef
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/mosdef
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/mosdef/
包短Url https://bioconductor.org/packages/mosdef/
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