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甲基CC

评估DNA甲基化样本中全血的细胞成分


生物导体版本:释放(3.19)

一种用于评估在任何平台技术(微阵列和测序)上测量的DNA甲基化全血样本的细胞组成的工具。

作者:斯蒂芬妮·希克斯[aut,cre],拉斐尔·伊里扎里[aut]

维护人员:斯蒂芬妮·希克斯(Stephanie C.Hicks)<shicks19 at jhu.edu>

引文(从R中输入引文(“甲基CC”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“甲基CC”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“甲基CC”)
甲基CC用户指南 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 DNA甲基化,甲基Seq,甲基化阵列,微阵列,排序,软件,全基因组
版本 1.18.0
在生物导体中 生物技术3.10(R-3.6)(4.5年)
许可证 GPL-3型
取决于 R(>=3.6),流排序。血量450k
进口 博科生物,基因组范围,I范围,S4载体,数字播放器,马格里特,米菲,bsseq公司,二次规划优化函数,plyranges系列,统计,实用程序,颠簸猎人,基因过滤器、方法、,IlluminaHumanMethylation450k最佳,IlluminaHumanMethylation450kanno.ilmn12.hg19公司
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/stephaniehicks/methylCC/
错误报告 https://github.com/stephaniehicks/methylCC/
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建议 rmarkdown公司,针织物,测试那个(>= 2.1.0),生物遗传学,仿生风格,第三年,ggplot2
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 甲基CC_1.18.0.tar.gz
Windows二进制 甲基CC_1.18.0.zip
macOS二进制(x86_64) 甲基CC_1.18.0.tgz
macOS二进制(arm64) 甲基CC_1.18.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methylCC
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包装/methylCC
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/methCC(网址:https://code.bioconductor.org/browse/methCC)/
包短Url https://bioductor.org/packages/methylCC/
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