注册打开对于生物20247月24-26日

甲基LImp2

DNA甲基化数据的缺失值估计


生物导体版本:释放(3.19)

这个软件包允许估计DNA甲基化数据中缺失的值。methyLImp方法基于线性回归,因为甲基化水平显示出高度的样本间相关性。由于不同染色体上的探针通常是独立的,因此在染色体上实现是并行的。在有大量样本可用的情况下,使用Mini-bactch方法来减少运行时间。

作者:Pietro Di Lena[奥特],安娜·普拉克西恩科[aut,cre],克劳迪娅·安吉利尼[aut],克里斯汀·纳迪尼

维护人员:安娜·普拉克西恩科(Anna Plaksienko)

引文(从R中输入引文(“methyLImp2”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“methyLImp2”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“methyLImp2”)
methyLImp2渐晕 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 脱氧核糖核酸甲基化,甲基化阵列,微阵列,回归,软件
版本 1.0.0
在生物导体中 生物活性碳3.19(R-4.4)(<6个月)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=4.3.0),ChAMP数据
进口 生物并行,并行,统计,方法,公司,总结性实验,实用程序
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/annaplaksienko/methyLImp2
错误报告 https://github.com/annaplaksienko/methyLImp2/issues网站
查看更多
建议 仿生风格,针织物,rmarkdown公司,拼写,测试那个(>= 3.0.0)
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 methyLImp2_1.0.0.tar.gz方法
Windows二进制 methyLImp2_1.0.0.zip码
macOS二进制(x86_64) 方法LImp2_1.0.0.tgz
macOS二进制(arm64) 方法LImp2_1.0.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/methyLImp2
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/methyLImp2
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/methyLImp2/
包短Url https://bioconductor.org/packages/methyLImp2(https://bioconductor.org/packages/methyLImp2)/
软件包下载报告 下载统计信息