mbkmeans（百万美元）

单细胞RNA-seq的Mini-bactch K-means聚类

生物导体版本：释放（3.19）

为大型数据集实现mini-bactch k-means算法，包括对磁盘数据表示的支持。

作者：倪宇伟[aut，cph]，大卫·里索[aut

维护人员：Davide Risso<gmail.com上的Risso.Davide>

引文（从R中输入引文（“mbkmeans”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“mbkmeans”）

对于旧版本的R，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览Vignette（“mbkmeans”）

生物视图	群集,基因表达式,RNA序列,排序,单个单元格,软件,转录组学
版本	1.20.0
在生物导体中	生物技术3.9（R-3.6）（5年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	R（>=3.6）
进口	方法，延迟阵列,卢比,S4载体,单细胞实验,总结性实验,群集R,基准,矩阵,生物并行
系统要求	C++11语言
统一资源定位地址
错误报告	https://github.com/drisso/mbkmeans/问题

建议	海滩上的人,HDF5阵列,Rhdf5库,仿生风格,TENxPBMC数据,拾荒者,延迟矩阵统计,咆哮,针织物,测试那个,rmarkdown公司
链接到	卢比,RcppArmadillo公司(>= 0.7.2),Rhdf5库,海滩上的人,群集R
增强功能
取决于我	OSCA基本
导入我	集群实验
建议我	咆哮,scDblFinder
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	百万像素平均值1.20.0.tar.gz
Windows二进制	mbkmeans_1.20.0.zip码
macOS二进制（x86_64）	mbkmeans_1.20.0.tgz格式
macOS二进制（arm64）	mbkmeans_1.20.0.tgz格式
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/mbkmeans网站
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：packages/mbkmeans（包/mbkmeans）
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/mbkmeans网站/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/mbkmeans网站/
软件包下载报告	下载统计信息