马尔
最大等级再现性
生物导体版本:释放(3.19)
marr(最大秩再现性)是一种非参数方法,它使用高维生物数据的最大秩统计量检测可再现信号。在这个R包中,我们实现了在高维生物复制实验中测量每个样本对的特征和每个特征的样本对的再现性的功能。该软件包中用户友好的绘图功能还可以绘制每个样本对和每个特征的样本对的特征再现性直方图。此外,我们的方法还允许用户根据输出可视化检查(直方图)选择最佳过滤阈值来识别可再现特征和样本对。该包还提供了通过可再现特征和/或样本对过滤的数据子集。
作者:Tusharkanti Ghosh[aut,cre],Max McGrath[aut],Daisy Philtron[aut',Katerina Kechris[aut],Debashis Ghosh[aut,cph]
维护人员:Tusharkanti Ghosh<tusharkantighosh30 at gmail.com>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“marr”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览Vignette(“marr”)
细节
生物视图 |
ChIPSeq公司,质谱学,代谢组学,质量控制,RNA序列,软件 |
版本 |
1.14.0 |
在生物导体中 |
生物柴油3.12(R-4.0)(4年) |
许可证 |
GPL(>=3) |
取决于 |
R(>=4.0) |
进口 |
卢比,总结性实验,实用程序,方法,ggplot2,数字播放器,马格里特,爱尔兰航空公司,S4载体 |
系统要求 |
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统一资源定位地址 |
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错误报告 |
https://github.com/Ghoshlab/marr/issues网站 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。