照明

分析Illumina微阵列输出文件


生物导体版本:释放(3.19)

用于分析Illumina微阵列输出文件的工具,包括IDAT。

作者:基思·巴格利[aut]、亨利克·本特森[aut]、卡斯珀·丹尼尔·汉森[auc,cre]、马特·里奇[aut】、迈克·L·史密斯[aut]:Tim Triche Jr.[ctb]

维护人员:卡斯珀·丹尼尔·汉森<kasperdanielhansen在gmail.com>

引文(从R中输入引文(“illuminaio”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“illuminaio”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“illuminaio”)
加密IDAT格式说明 PDF格式
illuminaio简介 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 数据导入,基础设施,微阵列,专有平台,软件
版本 0.46.0
在生物导体中 生物C 2.12(R-3.0)(11.5年)
许可证 GPL-2型
取决于
进口 底座64
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/HenrikBengtsson/luminaio
错误报告 https://github.com/HenrikBengtsson/illuminaio/issues
查看更多
建议 RU单位,生物遗传学,照明数据测试文件(>= 1.0.2),仿生风格
链接到
增强功能
取决于我 标准化450K,Rn头,瓦特瓜,EGSEA123公司
导入我 beadarray公司,大甜瓜,crlmm公司,甲基脲,米菲
建议我 利马
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 照度-0.46.0.tar.gz
Windows二进制 illuminaio_0.46.0.zip
macOS二进制(x86_64) 照明-0.46.0.tgz
macOS二进制(arm64) 照明-0.46.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/illuminaio网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包装/照明
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/luminaio/
包短Url https://bioconductor.org/packages/illuminaio网站/
软件包下载报告 下载统计信息