软篷帆布
R中的空间蜂窝邻域扫描
生物导体版本：释放（3.19）
hoodscanR是一个用户友好的R包，提供了帮助细胞邻域分析任何具有单细胞分辨率的空间转录组学数据的功能。该软件包中的所有功能都是基于SpatialExperiment对象构建的，允许集成到Bioconductor的各种空间转录组学相关软件包中。该包可以产生单元级的邻域注释输出，以及执行邻域协同定位分析和基于邻域的单元聚类的功能。
作者：刘宁[aut，cre]
，贾里德·马丁
维护人员：刘宁（音）<Liu.n at wehi.edu.au>
引文（从R中输入引文（“hoodscanR”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“hoodscanR”）
对于旧版本的R，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览渐晕图（“连帽衫”）
细节
| 生物视图 |
群集,单个单元格,软件,空间,转录组学 |
| 版本 |
1.2.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.18（R-4.3）（0.5年） |
| 许可证 |
GPL-3+文件许可证 |
| 取决于 |
R（>=4.3） |
| 进口 |
针织物,rmarkdown公司,空间实验,总结性实验,绕圈子,复杂热图,科学技术委员会,爱尔兰航空公司，实用程序，ggplot2，网格，方法，统计，RANN公司,卢比（>=1.0.9） |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/DavisLaboratory/hoodscanR https://davislaboratory.github.io/hoodscanR/ |
| 错误报告 |
https://github.com/DavisLaboratory/hoodscanR/issues网站 |
查看更多
| 建议 |
测试(>= 3.0.0),仿生风格 |
| 链接到 |
卢比 |
| 增强功能 |
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| 取决于我 |
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| 导入我 |
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| 建议我 |
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| 指向我的链接 |
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| 生成报告 |
生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
