基因组不稳定性

scRNA-Seq的基因组不稳定性估计

生物导体版本：释放（3.19）

该软件包包含从scRNA-Seq数据运行基因组不稳定性分析（GIA）的功能。GIA估计编码基因的基因表达和基因组位置之间的关联。它使用aREA算法量化基因表达谱上相邻基因集（loci-block）的富集程度，并估计每个分析细胞的基因组不稳定性得分（GIS）。

作者：Mariano Alvarez[aut，cre]，Pasquale Laise[aut]，达尔文健康[cph]

维护人员：玛丽亚诺·阿尔瓦雷斯（Mariano Alvarez）<reef103 at gmail.com>

引文（从R中输入引文（“基因组不稳定性”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“基因组不稳定性”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览渐晕图（“基因组不稳定性”）

生物视图	基因表达式,单个单元格,软件,系统生物学
版本	1.10.0
在生物导体中	生物柴油3.14（R-4.1）（3年）
许可证	文件许可证
取决于	R（>=4.1.0），将死
进口	混合工具,总结性实验
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/DarwinHealth/genomicInstability
错误报告	https://github.com/DarwinHealth/genomicInstability

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	基因组不稳定性_1.10.0.tar.gz
Windows二进制	基因组不稳定性_1.10.0.zip
macOS二进制（x86_64）	基因组不稳定性_1.10.0.tgz
macOS二进制（arm64）	基因组不稳定性_1.10.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/基因组不稳定性
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/基因组不稳定性
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/genemic不稳定性/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/基因组不稳定性/
软件包下载报告	下载统计信息