杰玛。对

Gemma Restful API的包装器，用于访问精心策划的基因表达数据和差异表达分析

生物导体版本：释放（3.19）

Gemma RESTful API的低级和高级包装器。它们可以访问来自10000多个已发表研究的精心策划的表达和差异表达数据。Gemma是一个网站、数据库和一套工具，用于基因组数据的荟萃分析、重用和共享，目前主要针对基因表达谱的分析。

作者：哈维尔·卡斯蒂略-阿内曼[aut]，Jordan Sicherman[aut]，奥甘·曼卡奇[cre，aut]，纪尧姆·波里埃尔·莫伦西[aut]

维护人员：Ogan Mancarci<Ogan.Mancarci at gmail.com>

引文（从R中输入引文（“gemma.R”）):

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）生物管理器：：安装（“gemma.R”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“gemma.R”）

生物视图	注释,BatchEffect（批次效果）,贝叶斯主义者,数据导入,差异表达式,实验设计,基因表达式,微阵列,规范化,预处理,单个单元格,软件,第三方客户
版本	3.0.7
在生物导体中	生物柴油3.16（R-4.2）（1.5年）
许可证	Apache许可证（>=2）
取决于
进口	马格里特,胶,备忘录,jsonlite公司,数据表,爱尔兰航空公司,杂交的，实用程序，字符串,总结性实验,博科生物,易怒的,第三年,S4载体,高温气冷堆,说唱歌手,位64,断言,消化
系统要求
统一资源定位地址	https://pavlidislab.github.io/gemma.R/ https://github.com/PavlidisLab/gemma.R
错误报告	https://github.com/PavlidisLab/gemma.R/issues网站

建议	测试那个(>= 2.0.0),rmarkdown公司,针织物,数字播放器,覆盖（covr）,ggplot2,gg排斥,生物风格,微基准,魔法,呜呜声,苯丙胺,翡翠色,汇集者,kableExtra（额外）,列表查看器,闪亮的
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告	生成报告

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	杰玛。R_3.0.7.tar.gz
Windows二进制	杰玛。R_3.0.6.zip拉链
macOS二进制（x86_64）	杰玛。R_3.0.4.tgz
macOS二进制（arm64）	杰玛。3.0.7.tgz兰特
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/gemma.R
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：packages/gemma。对
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/gemma.R/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/gemma.R/
软件包下载报告	下载统计信息
BioC 3.19的旧源代码包	源存档