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交互式应用程序的快速功能丰富
生物导体版本:释放(3.19)
使用超几何分布对特征列表(如基因或蛋白质)执行快速功能丰富。该软件包专为速度量身定制,是Shiny等交互式平台的理想选择。它支持从GO、KEGG、Reactome、Bioplanet和WikiPathways等来源检索功能数据。通过首先下载和准备数据,它可以对各种功能选择进行快速连续的测试,而不需要其他软件包典型的重复、耗时的准备步骤。
作者:马雷克·吉尔林斯基[aut,cre]
维护人员:马雷克·吉尔林斯基(Marek Gierlinski)
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“fenr”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“fenr”)
细节
生物视图 |
差异表达式,功能预测,GO(开始),GeneSet扩展,KEGG公司,蛋白质组学,反应途径,软件 |
版本 |
1.2.1 |
在生物导体中 |
生物柴油3.18(R-4.3)(0.5年) |
许可证 |
MIT+文件许可证 |
取决于 |
R(>=4.1.0) |
进口 |
工具、方法、,断言,爱尔兰航空公司,数字播放器,第三年,潮汐选择,易怒的,呜呜声,阅读器,字符串,高温气冷堆2,服务器,进步,生物文件缓存,闪亮的,ggplot2 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/bartongroup/fenr |
错误报告 |
https://github.com/bartongroup/fenr/issues(网址:https://github.com/bartongroup/fenr/issues) |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。