法斯赛格
fastseg&一种快速分割算法
生物导体版本：释放（3.19）
fastseg实现了一种快速高效的分割算法。它具有与DNACopy（Olshen和Venkatraman 2004）类似的功能，但速度更快，灵活性更强。fastseg可以从DNA微阵列和下一代测序中分割数据，例如检测拷贝数片段。此外，它还可以从RNA微阵列（如平铺阵列）中分割数据，以识别转录物。最常见的是，它可以分割作为矩阵或向量给出的数据。各种数据格式可以用作微阵列的类fastseg表达式集对象或测序数据的GRanges的输入。fastseg的分割标准基于贝叶斯框架中的统计测试，即网络t测试（Baldi 2001）。加速源于这样的事实，即对于fastseg不需要采样，并且使用动态规划方法计算分段的一阶矩和高阶矩。
作者：Guenter Klambauer[aut]、Sonali Kumari[ctb]、Alexander Blume[cre]
维护人员：亚历山大·布卢姆（Alexander Blume）<alex.gos90 at gmail.com>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“fastseg”）
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文档
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