fCCAC公司

功能典型相关分析评价核酸测序数据集之间的协方差

生物导体版本：释放（3.19）

跨DNA或RNA测序数据集的变异性计算评估是基因组学中的一个关键步骤，因为它既可以评估重复的再现性，也可以比较不同的数据集以确定潜在的相关性。fCCAC应用功能典型相关分析来评估：（i）生物或技术复制品的再现性，分析它们在高阶分量中的共享协方差；以及（ii）不同数据集之间的关联。fCCAC代表了一种更复杂的方法，补充了基因组覆盖率的皮尔逊相关性。

作者：佩德罗·麦德里加[aut，cre]

维护人员：佩德罗·麦德里加（Pedro Madrigal）<pmadrigal at ebi.ac.uk>

引文（从R中输入引文（“fCCAC”）):

安装

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如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“fCCAC”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

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fCCAC小品	PDF格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本

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细节

生物视图	ATAC当量,ChIPSeq公司,新闻报道,表观遗传学,功能基因组学,Mbase序列,RNA序列,排序,软件,转录
版本	1.30.0
在生物导体中	生物柴油3.4（R-3.3）（7.5年）
许可证	艺术-2.0
取决于	R（>=4.2.0），S4载体,I范围,基因组范围，网格
进口	食品药品管理局,R彩色啤酒,基因组学,ggplot2,复杂热图、grDevices、stats、utils
系统要求
统一资源定位地址

建议	RUnit（运行单位）,生物遗传学,仿生风格,针织物,rmarkdown公司
链接到
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	fCCAC_1.30.0.tar.gz
Windows二进制	fCCAC_1.30.0.zip文件
macOS二进制（x86_64）	fCCAC_1.30.0.tgz
macOS二进制（arm64）	fCCAC_1.30.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/fCCAC
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：包/fCCAC
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/fCCAC/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/fCCAC/
软件包下载报告	下载统计信息