避开（escheR）

统一多维可视化与格式塔原则

生物导体版本：释放（3.19）

创建有效的可视化是数据分析的基本组成部分。在生物医学研究中，在2D空间中可视化多维数据正面临新的挑战，但目前的数据可视化工具能力有限。为了解决这个问题，我们利用格式塔原理来改进二维数据可视化中多维数据的设计和解释，并通过分层美学来显示多个变量。所提出的可视化可以应用于空间解析转录组学数据，也可以广泛应用于二维空间中的可视化数据，例如嵌入可视化。我们提供了这个开源R包escheR，它基于最先进的ggplot2可视化框架构建，可以无缝集成到基因组学工具箱和工作流中。

作者：郭伯义[aut，cre]，斯蒂芬妮·希克斯[aut]，埃里克·D·纳尔逊

维护人员：郭伯义<郭伯义在gmail.com>工作

引文（从R中输入引文（“escheR”）):

安装

要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：

if（！require（“生物管理器”，悄悄=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“escheR”）

对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：

浏览幻影（“escheR”）

超越视觉	HTML格式	R脚本
开始使用`escheR`	HTML格式	R脚本
参考手册	PDF格式
新闻	文本
许可证	文本

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细节

生物视图	单个单元格,软件,空间,转录组学,可视化
版本	1.4.0
在生物导体中	生物C 3.17（R-4.3）（1年）
许可证	MIT+文件许可证
取决于	ggplot2，R（>=4.3）
进口	空间实验(>= 1.6.1),单细胞实验,爱尔兰航空公司,总结性实验
系统要求
统一资源定位地址	https://github.com/boyigo1/escheR
错误报告	https://github.com/boyiguo1/escheR/issues

建议	S示例数据,凹凸矩阵,针织物,rmarkdown公司,生物风格,ggpubr公司,尖叫声,散射,舷窗,修拉,己糖
链接到
增强功能
取决于我
导入我	聚光灯清扫器
建议我	tpSVG公司
指向我的链接
生成报告	生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包	电子病历_1.4.0.tar.gz
Windows二进制	escheR_1.4.0.zip
macOS二进制（x86_64）	电子病历_1.4.0.tgz
macOS二进制（arm64）	电子病历_1.4.0.tgz
源码库信息	git克隆https://git.bioconductor.org/packages/escheR
源存储库（开发人员访问）	git克隆git@git.bioconductor.org：程序包/escheR
Bioc软件包浏览器	https://code.bioconductor.org/browse/escheR/
包短Url	https://bioconductor.org/packages/escheR/
软件包下载报告	下载统计信息
BioC 3.19的旧源代码包	源存档