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逃跑

用于浓缩的简易单细胞分析平台


生物导体版本:释放(3.19)

在单细胞RNA测序的背景下促进基因集富集分析(GSEA)的桥接R包。使用原始计数信息、Seura对象或SingleCellExperiment格式,用户可以跨单个单元格执行和可视化ssGSEA、GSVA、AUCell和基于UCell的浓缩计算。

作者:尼克·博尔切丁[aut,cre],杰瑞德·安德鲁斯[aut]

维护人员:尼克·博尔切丁(Nick Borcherding)<ncborch at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“转义”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“escape”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“逃避”)
逃生上班 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 注释,分类,GeneSet扩展,基因信号,路径,排序,单个单元格,软件
版本 2.0.0
在生物导体中 生物柴油3.12(R-4.0)(3.5年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 R(>=4.1)
进口 AUCell公司,生物并行,gr设备,数字播放器,ggdist(ggdist),ggplot2,gg点密度,GSEA基础,GSVA公司,单细胞实验,ggridges公司,msigdbr公司,统计,重塑2,拼凑的,矩阵泛型,实用程序,总结性实验,UCell公司,字符串、方法、,修饰符对象
系统要求
统一资源定位地址
查看更多
建议 修拉,己糖,尖叫声,针织物,rmarkdown公司,降价,仿生风格,R彩色啤酒,爱尔兰航空公司,拼写,测试那个(>= 3.0.0),vdiffr公司
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 逃逸_2.0.0.tar.gz
Windows二进制 逃逸_2.0.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 逃逸_2.0.0.tgz
macOS二进制(arm64) 逃逸_2.0.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/escape
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/逃逸
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/escale/
包短Url https://bioconductor.org/packages/escape/
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