不协调的

非协调方法:一种新的微分相关方法


生物导体版本:释放(3.19)

不一致是一个R包,用于识别表型组之间不同关联的特征对,并将其应用于组学数据集。不一致使用一种混合模型,根据共表达或协同的类型“装箱”分子特征对。算法在“测序数据的差分相关”中作了进一步解释(Siska等人,2016年)。

作者:夏洛特·西斯卡[aut]、麦格拉思·马克斯[aut,cre]、卡特琳娜·凯克里斯[aut、cph、ths]

维护人员:McGrath Max<ucdenver.edu的Max.McGrath>

引文(从R中输入引用(“不一致”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“不一致”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“不协调”)
不协调R包:一种新的微分相关方法 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 生物学问题,遗传学,免疫肿瘤学,微阵列,RNA序列,软件,统计方法,mRNA微阵列
版本 1.28.0
在生物导体中 生物碳3.5(R-3.4)(7.5年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=4.1.0)
进口 卢比,博科生物,统计,白车身,gtools公司,MASS(质量)、工具、,数字播放器、方法、实用程序
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/siskac/discordant网站
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建议 仿生风格,针织物,测试那个(>= 3.0.0)
链接到 卢比
增强功能
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 不协调_1.28.0.tar.gz
Windows二进制 不协调_1.28.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 不协调_1.28.0.tgz
macOS二进制(arm64) 不协调_1.28.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/discordant
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/不协调
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/discordant网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/discordant网站/
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