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d结构

从RNA结构分析数据中识别差异反应区域


生物导体版本:释放(3.19)

dStruct从RNA结构分析数据中识别不同的反应区域。dStruct与广泛的结构组分析技术兼容,例如SHAPE MaP、DMS MaPseq、Structure Seq、SHAPE Seq等。有关基本方法,请参阅Choudhary等人的《基因组生物学》,2019。

作者:克里希纳·乔达里(Krishna Choudhary)[aut,cre],莎朗·阿维兰[aut]

维护人员:Krishna Choudhary在ucdavis.edu>

引文(从R中输入引文(“dStruct”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“dStruct”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“dStruct”)
使用“dStruct”进行差异RNA结构分析` HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 排序,软件,统计方法,结构预测
版本 1.10.0
在生物导体中 生物柴油3.14(R-4.1)(2.5年)
许可证 GPL(>=2)
取决于 R(>=4.1)
进口 动物园,ggplot2,呜呜声,重塑2,平行,I范围,S4载体,爱尔兰航空公司、grDevices、stats、utils
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/dataMaster-Kris/dStruct网站
错误报告 https://github.com/dataMaster-Kris/dStruct/issues网站
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 d结构_1.10.0.tar.gz
Windows二进制 dStruct_1.10.0.zip
macOS二进制(x86_64) d结构_1.10.0.tgz
macOS二进制(arm64) d结构_1.10.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/dStruct网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/d结构
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/dStruct网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/dStruct网站/
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