细胞查看器
用于R的交互式多通道图像查看器
生物导体版本:释放(3.19)
该R包支持多通道图像的交互式可视化,以及由成像质量细胞术和其他使用shinny的高度复用成像技术生成的分割掩模。细胞查看器界面分为图像级(合成和通道)和细胞级可视化(掩码)。它允许用户使用分割掩码覆盖单个图像,与SingleCellExperiment和SpatialExperiment对象很好地集成,以实现元数据可视化,并支持图像下载。
作者:拉斯·梅耶[aut,cre],尼尔·艾琳[aut]
维护人员:拉斯·梅耶(Lasse-Meyer)<Lasse.Meyer at dqbm.uzh.ch>
引文(从R中输入引文(“cytoviewer”)
):
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“cytoviewer”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览幻影(“细胞查看器”)
细节
生物视图 |
数据导入,免疫肿瘤学,多通道,一个频道,单个单元格,软件,空间,双通道 |
版本 |
1.4.0 |
在生物导体中 |
生物C 3.17(R-4.3)(1年) |
许可证 |
GPL-3型 |
取决于 |
|
进口 |
闪亮的,闪亮的仪表板,实用程序,颜色选择器,小贩,svg平移缩放,翡翠色,档案文件,gr设备,R彩色啤酒,斯格利特,EB图像、方法、,细胞描记器,单细胞实验,S4载体,总结性实验 |
系统要求 |
|
统一资源定位地址 |
https://github.com/BodenmillerGroup/cytoviewer网站 |
错误报告 |
https://github.com/BodenmillerGroup/cytoviewer/issues网站 |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。