compSPOT公司
compSPOT：用于识别和比较显著突变的基因组热点的工具
生物导体版本：释放（3.19）
克隆细胞群在癌症、癌前病变甚至临床正常组织中有共同的突变。这些突变的频率和位置可以预测预后和癌症风险。已经很好地证明，某些基因组区域增加了获得突变的敏感性。因此，突变敏感基因组区域可以作为预测癌症风险的标记。该软件包包含多个功能，用于建立显著突变热点，比较样本之间的热点突变负担，并对热点突变负担与个人癌症风险因素（如年龄、性别和致癌物接触史）之间的相关性进行探索性数据分析。该软件包允许用户识别强大的基因组标记，以帮助确定癌症风险。
作者：悉尼格兰特
，艾拉·桑普森[aut]，瑞亚·罗德里格斯[aut]，Gyorgy Paragh[aut]
维护人员：悉尼格兰特<悉尼。roswellpark.org上的Grant>
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：安装（“compSPOT”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“compSPOT”）
细节
| 生物视图 |
分类,DNASeq公司,多重比较,排序,单个单元格,软件,生存,技术,全基因组 |
| 版本 |
1.2.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.18（R-4.3）（0.5年） |
| 许可证 |
艺术-2.0 |
| 取决于 |
R（>=4.3.0） |
| 进口 |
统计，基础，ggplot2,巧妙地,马格里特,ggpubr公司,额外网格，实用程序，数据表 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/sydney-grant/compSPOT |
| 错误报告 |
https://github.com/sydney-grant/compSPOT/issues |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
