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clusterSeq(群集序列)

通过识别共表达模式对高通量测序数据进行聚类


生物导体版本:释放(3.19)

基于在多个(复制的)生物样本中的表达来识别共表达基因簇。

作者:Thomas J.Hardcastle[aut]、Irene Papatheodorou[aut]、Samuel Granjeaud[cre]

维护人员:塞缪尔·格拉杰奥(Samuel Granjeaud)<Samuel.Granjeaud at inserm.fr>

引文(从R中输入引文(“clusterSeq”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

if(!require(“生物管理器”,悄悄=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“clusterSeq”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览渐晕图(“clusterSeq”)
高级baySeq分析 PDF格式 R脚本
参考手册 PDF格式

细节

生物视图 群集,差异表达式,基因表达式,多重比较,排序,软件
版本 1.28.0
在生物导体中 生物活性炭3.5(R-3.4)(7年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=3.0)、方法,生物并行,bay序列,图形,统计,实用程序
进口 生物遗传学
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/samgg/clusterSeq
错误报告 https://github.com/samgg/clusterSeq/issues
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 集群Seq_1.28.0.tar.gz
Windows二进制 集群Seq_1.28.0.zip
macOS二进制(x86_64) 集群序列_1.28.0.tgz
macOS二进制(arm64) 集群Seq_1.28.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/clusterSeq
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:程序包/clusterSeq
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/clusterSeq网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/clusterSeq网站/
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