取消R

用于访问和建模MSKCC癌症基因组数据的图形用户界面


生物导体版本:释放(3.19)

该软件包是基于cgdsr和其他建模软件包的用户友好界面,用于探索、比较和分析所有可用的癌症数据(临床数据、基因突变、基因甲基化、基因表达、蛋白磷酸化、拷贝数改变)由纪念斯隆-凯特琳癌症中心(MSKCC)计算生物学中心主办。

作者:卡里姆·梅周德(Karim Mezhoud)。核安全与安保部。突尼斯核科学中心。

维护人员:卡里姆·梅周德(Karim Mezhoud)<kmezhoud at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“canceR”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“canceR”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览Vignets(“取消”)
canceR:用于访问和建模MSKCC癌症基因组数据的图形用户界面 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 群集,GO(开始),图形用户界面,基因表达式,GeneSet扩展,KEGG公司,多重比较,软件
版本 1.38.0
在生物导体中 生物C 3.1(R-3.2)(9.5年)
许可证 GPL-2型
取决于 R(>=4.3),tcltk,cBioPortalData公司
进口 GSEA基地,tkrplot公司,geNet分类器,RUnit(运行单位),公式,r零件,生存,博科生物,表型试验,绕圈子,普利尔,第三年,数字播放器、图形、统计、实用程序、grDevices、,R.oo公司,R.方法S3
系统要求 Tktable,BWidget公司
统一资源定位地址
错误报告 https://github.com/kmezhoud/canceR/issues
查看更多
建议 测试那个(>= 3.1),针织物,rmarkdown公司,仿生风格
链接到
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 取消R_1.38.0.tar.gz
Windows二进制 取消R_1.38.0.zip
macOS二进制(x86_64) 取消R_1.38.0.tgz
macOS二进制(arm64) 取消R_1.38.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/canceR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:程序包/canceR
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/canceR网址/
包短Url https://bioconductor.org/packages/canceR/
软件包下载报告 下载统计信息