取消R
用于访问和建模MSKCC癌症基因组数据的图形用户界面
生物导体版本:释放(3.19)
该软件包是基于cgdsr和其他建模软件包的用户友好界面,用于探索、比较和分析所有可用的癌症数据(临床数据、基因突变、基因甲基化、基因表达、蛋白磷酸化、拷贝数改变)由纪念斯隆-凯特琳癌症中心(MSKCC)计算生物学中心主办。
作者:卡里姆·梅周德(Karim Mezhoud)。核安全与安保部。突尼斯核科学中心。
维护人员:卡里姆·梅周德(Karim Mezhoud)<kmezhoud at gmail.com>
安装
要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:
如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“canceR”)
对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:
浏览Vignets(“取消”)
细节
生物视图 |
群集,GO(开始),图形用户界面,基因表达式,GeneSet扩展,KEGG公司,多重比较,软件 |
版本 |
1.38.0 |
在生物导体中 |
生物C 3.1(R-3.2)(9.5年) |
许可证 |
GPL-2型 |
取决于 |
R(>=4.3),tcltk,cBioPortalData公司 |
进口 |
GSEA基地,tkrplot公司,geNet分类器,RUnit(运行单位),公式,r零件,生存,博科生物,表型试验,绕圈子,普利尔,第三年,数字播放器、图形、统计、实用程序、grDevices、,R.oo公司,R.方法S3 |
系统要求 |
Tktable,BWidget公司 |
统一资源定位地址 |
|
错误报告 |
https://github.com/kmezhoud/canceR/issues |
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程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。