错误信息br

R端访问BugSigDB发布的微生物特征


生物导体版本:释放(3.19)

bugsigdbr包实现了从R/Bioconductor中方便地访问bugsigb.org。该包的目标是促进将BugSigDB数据导入R/Bioconductor,提供提取微生物特征码的实用程序,并支持将提取的特征码以标准文件格式(如GMT)导出到纯文本文件。

作者:路德维希·盖斯林格[aut,cre],詹妮弗·沃卡蒂[aut],李维·沃尔德龙[aut]

维护人员:路德维希·盖斯林格(Ludwig Geistlinger)<Ludwig.Geistlinger at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“bugsigdbr”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“bugsigdbr”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“bugsigdbr”)
R侧访问BugSigDB HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本

细节

生物视图 数据导入,GeneSet扩展,基因组,微生物组,软件
版本 1.10.1
在生物导体中 生物柴油3.14(R-4.1)(3年)
许可证 GPL-3公司
取决于 R(>=4.1)
进口 生物文件缓存、方法、,房间,实用程序
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/waldronlab/bugsigdbr
错误报告 https://github.com/waldronlab/bugsigdbr/问题
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建议 仿生风格,针织物,本体索引,rmarkdown公司,测试那个(>= 3.0.0)
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 错误代码br_1.10.1.tar.gz
Windows二进制 bugsigdbr_1.10.1.zip
macOS二进制(x86_64) 错误代码br_1.10.0.tgz
macOS二进制(arm64) 错误代码br_1.10.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/bugsigdbr
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/错误br
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/bugsigdbr/
包短Url https://bioconductor.org/packages/bugsigdbr/
软件包下载报告 下载统计信息
BioC 3.19的旧源程序包 源存档