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条形码跟踪R

用于分析蜂窝条形码数据的功能


生物导体版本:释放(3.19)

barcodetrackR是一个R包,用于分析和可视化克隆跟踪数据。所需数据是矩阵形式的样本和标签丰度。通常来自细胞条形码实验、集成站点检索分析或类似技术。

作者:迭戈·亚历山大·埃斯皮诺萨[aut,cre],莱兰·莫特洛克[aut]

维护人员:迭戈·亚历山大·埃斯皮诺萨(Diego Alexander Espinoza)<Diego.Espinoza at pennmedicine.upenn.edu>

引文(从R中输入引文(“条形码跟踪R”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“barcodetrackR”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“barcodetrackR”)
条形码跟踪R HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 排序,软件,可视化
版本 1.12.0
在生物导体中 生物化学3.13(R-4.1)(3年)
许可证 文件许可证
取决于 R(>=4.1)
进口 奶牛场,绕圈子,数字播放器,ggplot2,ggdendro公司,ggridges公司、图形、grDevices、,马格里特,普利尔,代理,R彩色啤酒,爱尔兰航空公司,规模,闪亮的,统计,总结性实验,S4载体,易怒的,第三年,素食主义者,翡翠色,实用程序
系统要求
统一资源定位地址 https://github.com/dunbarlabNIH/barcodetrackR
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 条形码轨迹R_1.12.0.tar.gz
Windows二进制 条形码跟踪R_1.12.0.zip
macOS二进制(x86_64) 条形码跟踪R_1.12.0.tgz
macOS二进制(arm64) 条形码跟踪R_1.12.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/barcodetrackR
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包/条形码跟踪R
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/barcodetrackR/
包短Url https://bioconductor.org/packages/barcodetrackR/
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