注册打开对于生物20247月24-26日

阿列文QC

生成Alevin输出的QC报告


生物导体版本:释放(3.19)

生成质量控制报告,总结alevin、alevin-fry或simpleaf运行的输出。报告可以生成为html或pdf文件,也可以生成为闪亮的应用程序。

作者:夏洛特·索尼森,Avi Srivastava[aut],Rob Patro[aut],Dongze He[aut]

维护人员:夏洛特·索尼森

引文(从R中输入引文(“alevinQC”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::安装(“alevinQC”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“alevinQC”)
阿列文QC HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
新闻 文本
许可证 文本

细节

生物视图 质量控制,单个单元格,软件
版本 1.20.0
在生物导体中 生物技术3.9(R-3.6)(5年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 R(>=4.0)
进口 rmarkdown公司(>=2.5)、工具、方法、,ggplot2(>= 3.4.0),GGally公司,数字播放器,rjson语言,闪亮的,闪亮的仪表板,DT公司,统计,实用程序,tximport(最大端口)(>= 1.17.4),奶牛场,爱尔兰航空公司,卢比
系统要求 C++11语言
统一资源定位地址 https://github.com/csoneson/alevinQC
错误报告 https://github.com/csoneson/alevinQC/issues网站
查看更多
建议 针织物,生物风格,测试那个(>= 3.0.0),生物技术经理
链接到 卢比
增强功能
取决于我
导入我
建议我
指向我的链接
生成报告 生成报告

程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 alevinQC_1.20.0.tar.gz
Windows二进制 alevinQC_1.20.0.zip(仅64位)
macOS二进制(x86_64) 阿列文QC_1.20.0.tgz
macOS二进制(arm64) 阿列文QC_1.20.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/alevinQC
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:包裹/alevinQC
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/alevinQC/
包短Url https://bioconductor.org/packages/alevinQC/
软件包下载报告 下载统计信息