雪花石膏.files

保存常用文件格式的包装


生物导体版本:释放(3.19)

在雪花石膏框架中保存常见的生物信息学文件格式。这包括BAM、BED、VCF、bigWig、bigBed、FASTQ、FASTA等。我们为每个文件保存和加载额外的元数据,并支持每个文件与其对应索引之间的链接。

作者:亚伦·伦〔aut,cre〕

维护人员:亚伦·伦(Aaron Lun)<infine.monkeys.with.keyboards at gmail.com>

引文(从R中输入引文(“alabaster.files”)):

安装

要安装此软件包,请启动R(版本“4.4”)并输入:

如果(!require(“BiocManager”,悄悄地=TRUE))install.packages(“BiocManager”)BiocManager::install(“雪花石膏文件”)

对于R的旧版本,请参阅相应的生物导体释放.

文档

要查看系统中安装的此软件包版本的文档,请启动R并输入:

浏览幻影(“雪花石膏文件”)
保存常用文件格式 HTML格式 R脚本
参考手册 PDF格式
许可证 文本

细节

生物视图 数据导入,数据表示,软件
版本 1.2.0
在生物导体中 生物柴油3.18(R-4.3)(1年)
许可证 MIT+文件许可证
取决于 雪花石膏底座
进口 方法,S4载体,生物遗传学,Rsamtools软件
系统要求
统一资源定位地址
查看更多
建议 仿生风格,rmarkdown公司,针织物,测试那个,变量注释,rtracklayer公司,生物串
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增强功能
取决于我
导入我
建议我
链接到我
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程序包档案

跟随安装在R会话中使用此包的说明。

源程序包 雪花石膏文件_1.2.0.tar.gz
Windows二进制 雪花石膏.files_1.2.0.zip
macOS二进制(x86_64) 雪花石膏.files_1.2.0.tgz
macOS二进制(arm64) 雪花石膏.files_1.2.0.tgz
源码库信息 git克隆https://git.bioconductor.org/packages/alabaster.files网站
源存储库(开发人员访问) git克隆git@git.bioconductor.org:packages/alabaster.files
Bioc软件包浏览器 https://code.bioconductor.org/browse/alabaster.files网站/
包短Url https://bioconductor.org/packages/alabaster.files网站/
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