聚合BioVar
多主体scRNA-seq的差异基因表达分析
生物导体版本：释放（3.19）
对于从多个受试者（例如生物样品或技术复制品）收集的单细胞RNA-seq数据，该软件包包含用于总结受试者水平的单细胞基因表达谱的工具。将SingleCellExperiment对象作为输入，并转换为SummarizedExperience对象的列表，其中每个列表元素都对应于指定的单元格类型。SummarizedExperiment对象包含单个受试者的聚合基因-受试者计数矩阵和受试者间列元数据，可以使用下游批量RNA-seq工具进行处理。
作者：杰森·拉特克利夫[aut，cre]
、安德鲁·瑟曼【aut】、迈克尔·奇门蒂【ctb】、亚历杭德罗·佩祖洛【ctb）
维护人员：杰森·拉特克利夫（Jason Ratcliff）
引文（从R中输入引文（“aggregateBioVar”）):
安装
要安装此软件包，请启动R（版本“4.4”）并输入：
如果（！require（“BiocManager”，悄悄地=TRUE））install.packages（“BiocManager”）BiocManager:：install（“aggregateBioVar”）
对于R的旧版本，请参阅相应的生物导体释放.
文档
要查看系统中安装的此软件包版本的文档，请启动R并输入：
浏览幻影（“聚合BioVar”）
细节
| 生物视图 |
差异表达式,基因表达式,RNA序列,单个单元格,软件,转录,转录组学 |
| 版本 |
1.14.0 |
| 在生物导体中 |
生物柴油3.12（R-4.0）（3.5年） |
| 许可证 |
GPL-3型 |
| 取决于 |
R（>=4.0） |
| 进口 |
统计、方法、，S4载体,总结性实验,单细胞实验,矩阵,易怒的,爱尔兰航空公司 |
| 系统要求 |
|
| 统一资源定位地址 |
https://github.com/jasonratcliff/aggregateBioVar |
| 错误报告 |
https://github.com/jasonratcliff/aggregateBioVar/issues |
查看更多
| 建议 |
仿生风格,魔法,针织物,rmarkdown公司,测试那个,生物遗传学,DESeq2公司,马格里特,数字播放器,ggplot2,奶牛场,ggtext（gg文本）,R彩色啤酒,情势图,翡翠色 |
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生成报告 |
程序包档案
跟随安装在R会话中使用此包的说明。
